生命
氨基酸和核苷酸的故事

二

喜蹚历史浑水，
寻觅智慧的足迹。。。

古月語
　

生命学概论

二○○五年六月六日

摘要

本文將闡明：
生命這個宇宙間最複雜的事物，卻只是由一種構件──蛋白質建成！DNA只是蛋白質執行指令的程式庫。蛋白質是生命指令的最佳執行者，最佳偵錯者，也是宇宙間最優異的建材。所以能夠成為生命的締造者，成功利用進化篩選出最優秀的生命──人類。
進化的生命學原理。
『人們的社會存在決定人們的社會意識』的生命學原理。階級這個概念並不符合生命學原理。以本能和智慧來理解複雜的社會現象更為科學。
學習及聰明的生命學原理。
愛情的生命學原理。
疾病的生命學原理。
智慧的生命學原理。等等。
生命現象可以分解成兩大類：本能和智慧。DNA這個生命程式庫因應也可以分解成第一生命程式即本能程式與第二生命程式即智慧程式。蛋白質在卅億年進化中累積寫入DNA構成本能程式，可以遺傳。智慧程式是生命個體誕生後才寫入的程式，不具有即時的遺傳性。
一切生物的一切行為，都是根據本能程式，都是承自先天遺傳。而人類，也只有人類，可以臨時根據智慧程式對外界訊號做出更切貼的反應。
當智慧程式成為預設程式的時候，人只不過是蛋白質的傀儡。人類的行為究竟是一種本能還是一種智慧？這是生命學要研究的最根本課題。智慧程式是蛋白質的最新進化，人類應該利用蛋白質提供的智慧程式尋求人類的最佳歸宿。

　

小標題

生命學的前提
生命學的緣起
生命現象的根源──基本假設
『誰』才是生命的主宰
生命現象大分類
蛋白質如何執行指令
智慧程式和智慧
生命學的課題

　

生命學的前提

生命的根本只能在生物身上，而不在生物之外。生命學如果不堅持一元論，就必定淪為宗教。
承認個人的渺小和宇宙的無窮性，因此承認個人（不管是誰）認知的有限性，承認外在世界的無限性，這是智慧得以確立的根本前提。而一切『真理』只是由人提出，經過人口出來的概念從來都存在認知的局限性，一切『常識』亦只是由人總結出來，也必定存在或多或少的局限性，因此它們只能從屬於智慧，不能凌駕在智慧之上，必須接受智慧的檢驗。在智慧面前沒有任何事物可以豁免檢驗。

　

生命學的緣起

一個人的行為到底是一種本能，還是一種智慧？所有人的行為構成社會現象。我們的社會到底只是一堆本能的雜燴，還是智慧融合？
隨著科技的日新月異，人罹患的疾病也日新月異。隨著對人類健康問題的深入研究，人們驚嘆生命的完美。生命是一部完美的自動機，可以隨著外在環境的變化，做出適當的反應，保持生命的運作和延續。人對周圍的人的反應構成社會現象，今天人們見到的社會現象是否是生命進化的必然？
生命的根本是甚麼？人言人殊，宗教家和科學家各有不同的生命版本。生命就是生命學的研究對象，卻又是宇宙中最複雜的事物，如果能夠從一個最簡潔的事實出發，自圓其說的回答這部自動機的原理，根據這個原理闡明生物的行為，闡明人類的社會現象，這應該可以構成一套生命學了。
在這裏，筆者堅持一元論，生命的根本只能在生物身上尋找，生命的根本不在生物之外。
生命學不應該是一門實驗科學，而只是一種理論，甚至只是一個假說。生命是人類接觸得最多的東西，可是卻是最說不清的東西。今天，生命學就是要將人類一直接觸得到的『生命』說出一個道理來，說出一個能夠自圓其說的理論來。人類應該好好對『它』作一個總結了。在這裏斬釘截鐵的說，所有和生物學有關聯的學科，甚至連蛋白質組學(Proteomics)都還不是生命學。生物學及其關聯學科只是知其然而不知其所以然的學科，生命學必須是一科知其然又知其所以然的學科。

生命學最主要的目的，就是闡明生物各種行為的根本原因，對人類行為來說，就是要闡明它是一種本能還是一種智慧？當我們知道了自己行為的根本原因之後，至少，我們可以清晰的知道自己在做甚麼，認真的瞭解他人對自己行為的反應，不讓蛋白質限制自己，也給他人一個機會。只有所有人認識了這點，才能完成自從蛋白質在宇宙出現後的最終進化。
　

生命現象的根源
──生命學的最基本假設

人類已經掌握了這樣一個事實：在人類認為是有生命的地方就一定有蛋白質（蛋白質一詞在本文泛指由氨基酸編碼而成的大分子，包括一級結構的線性氨基酸鏈，不同肽鍵的二級結構，一條多肽鏈的三級結構和多條多肽鏈的四級結構）。最近的幾十年，人類又掌握了一個這樣的事實：有生命的地方就一定有DNA，沒有DNA就不會有生命。
蛋白質和DNA都可以數碼化。所謂數碼化，廣義的說，即任何一類事物，如果可以將它分解成為數不多（數個至數十個）的元素（即廣義上的數碼，狹義上的數碼單指0和1），而這些元素的有規律組合（即編碼）都可以構成這類事物（這相當於數學上的群的概念）。

任何程式都是一種編碼，必須能夠數碼化的事物才能夠編碼。程式必須是一套（至少是局部）完整的指令記錄，DNA是程式。蛋白質可以編碼，卻不是程式，是指令執行者。
蛋白質的數碼是二十種氨基酸。氨基酸是人類已經可以準確掌握了的化學分子，任何生物身上的蛋白質必定是以這二十種氨基酸的一組編碼為基礎架構而成。因為由二十種氨基酸可以得出無限的編碼，所以蛋白質的種類是無限的。
DNA(Deoxyribonucleic acid)是脫氧核糖核酸的拉丁字母符號。脫氧核糖核酸一共有四個核苷酸鹼基：A（adenine）腺嘌呤、T（thymine）胸腺嘧啶（或RNA的U尿嘧啶uracil）、G（guanine）鳥嘌呤和C（cytosine）胞嘧啶。A、T（U）、G、C就是DNA（或RNA－Ribonucleic Acid核糖核酸）的數碼，任何DNA（RNA）都是A、T（U）、G、C的一組編碼。A、T（U）、G、C中的某三個對應一個氨基酸。
無論是氨基酸還是核苷酸都是由碳原子架構。因為碳原子有四個化學鍵，加上碳原子和氮、氫等之間的化學鍵，因此蛋白質和脫氧核糖核酸具有立體結構。所謂立體結構，即銜接不僅僅限於頭尾兩端，亦可攔腰銜入形成分支（脫氧核糖核酸沒有形成複雜的分支，卻和另一條對應的脫氧核糖核酸耦合形成穩定的結構）。因此蛋白質能夠和蛋白質或其他的化學分子作立體耦合，從而使蛋白質成了分子開關。
所謂分子開關，即任何分子都具有自身才有的化學功能，而當它和其它化學分子結合（耦合）或被其它化學分子分解的時候，它將失去原有的化學功能而獲得新的化學功能。如果這個分子僅僅是只能和某單個化學分子反應，我們不能稱它具有開關性質，只有它可以和數個甚至無限個化學分子（主要是同類）結合成更大分子或產生分解反應成更小分子的時候，才真正具有開關的意義。

類似於兒童玩的積木，我們可以用少數的元件，堆砌出複雜的構件，並且在已經砌成的構件任一點上再插上另一構件，一樣可以成為更大的構件，蛋白質就是具有這樣的屬性。正是這樣的屬性使蛋白質從最簡單的型態可以進化到今天最完美的生命。正是這個屬性使蛋白質成了指令的最佳執行者，也成了指令的最佳偵錯者。也正是這個屬性使蛋白質成了宇宙間最優異的建材（人類設計的機械儀器還做不到關節、肌肉，昆蟲翅膀、定位器及各類器官那麼精巧）。就是這個屬性使蛋白質成了宇宙的唯一驕子，由它單獨構造了生命。宇宙間最複雜的事物，卻只是由一種構件──蛋白質建成！蛋白質在漫長的進化中利用自己的屬性優化了生命，同時執行生命指令，構成生命的建材。
蛋白質的分子開關屬性，已經獲得了科學家的實驗證實。他們將百餘種簡單的蛋白質放在一個培養皿裏培養，結果僅僅是六代（微生物的『代』）的時間就見到了蛋白質的自行重組，重組出來蛋白質具有了原來的蛋白質不曾具有的分解脂肪的能力。這個蛋白質的重組，由分子開關和可以編碼屬性造成。
因此蛋白質的分子開關屬性和它的無限性結構及可以編碼這三個因素是一切生命得以形成的最根本也是唯一的原因。如果宇宙間不曾有蛋白質，而又不同時具有這三個屬性，這個世界就不會有生命。蛋白質的分子開關屬性是生命學的根本原理，是生命學的基石，是生命學的最基本假設，這個假設若不成立，生命學就是一堆廢話。
有了這個基本假設，我們就可以用它來解釋：為甚麼我們看到的生物是這個樣子，為甚麼有這樣的進化，生命為甚麼進化到人類，進而研究人類社會為甚麼是這個樣子，人類的最後歸宿在哪裏。

蛋白質種類的無限性決定了生命的種類的龐雜。當初蛋白質以自身的開關屬性架構生命，並非一開始就十分精良，功能不全的生命無法對自然環境作出正確的反應而不能存活下來，能夠存活下來的就相對精良了。如果將那些並不能繁衍下去的生命計入，我們所見到的生命何止是現在的這些。
進化並非是『物競天擇』，而只是蛋白質的分子開關的必然。當兩種蛋白質碰在一起，如果可以形成開關，就一定互相交換各自的『數碼元件』而變成新的蛋白質，可以是一個，也可以是數個。這就是『洗牌效應』的生命學原理。如果新的蛋白質可以啟動DNA，由於蛋白質是最佳的指令偵錯者，只要可以打開DNA，這種新蛋白質的編碼程序就會寫入DNA裏而獲得遺傳特性。如果新的變種不能駕馭環境的變化，就不能生存下去，地球上從此就再也見不到這個變種了。無數的變種總會得到新的對生存環境具有更優異的駕馭能力的生命物種。這就是進化的生命學原理。因此這就是我們見到病毒和病菌的變異，變得更具有抗藥性的根本原因，當人口密度和牲畜密度達到一個臨界點的時候，這種變異將會快得令人恐怖。
例如，加拿大一種細小灌木是植物世界的「最快的飛彈發射器」。科學家發現，它藉其天然的「彈射系統」結構，傳播花粉的速度甚至比升空火箭還要快上數百倍。這種加拿大山茱萸屬（Cornus canadensis）的植物，名叫御膳橘（bunchberry dogwood），生長於北美洲廣闊的沼澤帶針葉森林，它生長到20公分高時，便需以爆炸力彈射花粉到比自身高10倍的高度，好將花粉送入樹林隨風飄散，這並不是它有意識的爭取最大的播種繁殖機會，也不是『上帝』的傑作，只純粹是蛋白質的開關屬性造成的進化。

朊毒體（由美國舊金山加利福尼亞大學的斯坦利·B·布魯辛納（Stanley B. Prusiner）於1982年發現的）這種具有感染性的蛋白質主要由被稱爲PrP的蛋白質組成的。這種蛋白質可以在細胞的膜上找到（具體功能還不瞭解）。朊毒體似乎在直接與受感染的組織接觸時感染性很強。通常也認爲，食用受感染的動物可以通過積累緩慢地引起疾病，特別是可以引起朊毒體在世代間積累的同類相食或類似的行爲，例如太平洋一個小島上發生的庫魯病。因此，我們在自然界幾乎見不到有動物吃同類的肉，因這類物種不可能獲得繁衍。雖然同類相食造成災難這種風險沒有被證明，但是現代農場不接受給反芻動物餵養反芻動物蛋白質粉末就是一個警惕。朊毒體是一種非常活躍的蛋白質，它並不和受感染的蛋白質交換『數碼元件』，而是將受感染的蛋白質的『數碼元件』按自己的面目重新編碼成和自己一樣的蛋白質，這種功能和偵錯功能十分類似。因此，朊毒體的行為證實了蛋白質是一種分子開關。
　

『誰』才是生命的主宰？

由碳原子夥同氫、氧、氮、磷、硫等元素聚合出第一個氨基酸，大自然用了一百億年。由第一個氨基酸進化到現在的多姿多彩生命世界，大自然花費了卅億年。

之所以需要卅億年的時間，是因為在無邊無際的宇宙裏兩個蛋白質碰到一起耦合的機會幾乎是零(一年有3X10^7、即三千萬餘秒，10^7表示1之後有7個0，如果兩個蛋白質在一秒鐘碰到一起的機會是萬億分之一，一億年就有100個機會了，一旦碰上，就不會中斷了，這裏的數字並非是精確的科學數據，只是用於說明渺茫的機會在漫長的時間等待下，機會並非等於零)，在實驗室的培養皿裏是人為將它們集合在一處，因此只需短時間就可以耦合演變成不同的蛋白質了。已經有科學家計劃，從最簡單的蛋白質開始，在實驗室裏重演大自然裏生命進化的歷程。
蛋白質花三十多億年進化，寫成了生命程式DNA，我們不知道哪一條DNA，或者被認為是垃圾的DNA，完整的記錄了這個漫長的、曲折的歷程。如果我們觀察人類胎兒在母體的演化過程，就會相信有這樣的DNA。
我們是否有足夠的理據來決定蛋白質和DNA哪一個才是生命的主角？誰操控了整個生命劇情，誰就是主角，這是判定誰是主角的唯一準則。
蛋白質是不是主角的最關鍵事實是誰是生命指令的執行者？這裏，我們只須探討一個這樣的問題就可以論斷：蛋白質不但是生命指令的司令，也是生命指令的執行者。這個問題就是：誰啟動了，因而下達生命指令？又是誰監督並執行生命指令？
無論是在幹細胞的研究中，還是在基因工程中，科學家已經證實無論是DNA的打開、DNA片段的搜索、切入、銜接、偵錯等都得通過各種酶也即是蛋白質進行，DNA只是一部檔案而已，是蛋白質操控了DNA，因此，蛋白質才是生命的主宰，DNA是蛋白質用以複製自己的資料庫。甚麼時候複製，複製甚麼蛋白質卻是蛋白質根據生化環境來決定。

史丹佛大學醫學院神經學及神經科學系副教授蘭度博士（Thomas Rando, MD, PhD）的研究發現肌肉組織上佈滿的肌肉幹細胞（muscle stem cells）當肌肉受傷，會出動營救進行修補，條件是它必須獲得年輕者的血液供應，既使該幹細胞是屬老者亦一樣。即不論是年輕者或老者身上的幹細胞，只要得到的是年輕者血液（實驗室做得到），就會出動營救進行修補，得到的是老者血液，就沒有這個活性。不但肌肉幹細胞是如此，同樣有證據證明，肝等器官細胞也如此。這說明生命活動源自酶，即蛋白質，而不是DNA。
一般的生命活動機制是這樣的：生化環境產生的化學分子打開了相應的蛋白質分子開關（即激活一詞在生命學中的全部涵義），從而開啟了一系列的生化反應，產生了生命現象。例如，打開DNA的一節，將它轉錄成RNA，再進一步製造相關的蛋白質，構造出生命所需的建材和能源，維持生命的生存。當生命建材最後齊備時，複製出另一條DNA來完成生命的繁殖──分家。
蜜蜂和螞蟻這類昆蟲，通過給幼蟲餵食蜂皇漿、蟻皇漿荷爾蒙一類的蛋白質，孕育出一個生命群體的生殖個體而延續生命，當新的蜂后、蟻后和雄蜂、雄蟻成熟時，它們就會分家。這個生命現象又一次證實了是蛋白質控制DNA。
每一條染色體，每一條完備的DNA必定伴有酶，無論稱之為『開啟酶』、『解讀酶』『錄取酶』都好，總之是蛋白質，這些酶是DNA的『守護神』，也是使用者，沒有它，DNA只是一條廢物。
這裏必須弄清的是，DNA是密封的，外界的生化分子（物理環境例外）是不能直接打開DNA。能夠打開DNA的是相應的守護神──酶，而一條完備的DNA並非只有一個守護神，十分精確的生命活動，豈可以只由一個酶來啟動？

要啟動DNA，必須先啟動守護神，要使DNA產生變異，必須先改變它的『守護神』，因為DNA閉合前，守護神會進行偵錯程序。
史丹佛大學醫學院神經學及神經科學系副教授蘭度博士的研究說明，來自外界的訊號，肌肉受傷所釋出的生化分子仍然啟動不了幹細胞DNA的守護神，還必須年輕血液中的某些酶才可以雙劍合璧啟動守護神。
這有點像銀行的金庫需要兩個不同級別的經理的鑰匙才能打開門上的開關。卵子和精子的結合正是暗示了高級生命的開始需要兩把鑰匙同時開啟。精子帶來的酶和卵子帶來的酶，還需要子宮的酶（這種酶是訊號──指令的攜帶者），通過開關屬性形成三劍合璧，從而啟動了一個新生命的『製造』程序。
蛋白質操控生命的理據同時也可以由病毒的行為得到支持。病毒有不完備的DNA，或只是RNA，卻沒有完整的生命所必需的蛋白質──酶，因此無法建構必需的生命建材，無法繁殖。因此我們看到病毒為甚麼需要進入真核細胞才能完成繁殖的生命現象，因為病毒不具有這些酶，它必需借助具有完整的酶的真核細胞的相關酶來完成繁殖功能。至於病毒為甚麼會有將自己的DNA（或RNA）注入真核細胞這種行為，可以由蛋白質的開關屬性獲得解釋。當病毒的DNA（或RNA）進入真核細胞使寄主的DNA失效，亦一樣可以由蛋白質的開關屬性獲得解釋。當然所有細節仍須通過實驗證實。
例如，被人視為惡魔的SARS，冠狀病毒，為甚麼只是感染肺部，因為冠狀病毒外層的蛋白質和肺細胞的蛋白質可以形成開關。這也是所有的疾病的生命學原理。

多細胞生物為甚麼到了一定的時候就會停止分裂，這是因為它產生了人類仍然不知道的『關閉酶』、『封條酶』（現在流行，或接近證實的說法是基因的末端有『端子』，每分裂一次，端子就減少一個，當端子已經消耗殆盡，細胞就不再分裂而『死亡』）。
這種酶被毀壞後細胞又會開始分裂，我們看到的癌細胞就是被『撕掉』了『封條』的細胞，癌細胞可以自己架設血管攫取營養，卻又是不能在適當的時候停止分裂，破壞了生命完整。
長期新陳代謝累積的廢物和自由基，嚴重干擾或『篡改』了控制DNA的蛋白質──酶（這也是蛋白質的分子開關屬性造成），一個沒有遇到阻力的生化訊號啟動了變異酶開始不正常的生命程序，發生了癌變。
癌細胞只是一個被破壞了『封條』而又沒有恢復必需而正確的其它酶，因此不能造就一個正確的器官。原因可能是外界破壞了『封條酶』之後又改變了基因。但最大的可能是DNA被『貼上』『封條』時執行正確分裂指令的酶也被『革除』了。
實際情況可能複雜得多。守護神──酶的正確功能被關閉的同時開啟了錯誤的功能，或者具有偵錯功能的酶被關押，跟著，DNA也被篡改了，一切被搞到面目全非。而『入侵者』要接近守護神肯定不是一夜之間、更不是一件輕易的事。
筆者的這個概念和歷來的概念不同，過去人們一直以為癌變是DNA變異引致。現在已經證實癌細胞人人都有，但發展成惡性腫瘤，卻仍然必須借助某種生理條件，這就是機體失去了封閉癌細胞活動的酶，或者它被廢除了武功，甚至是被廢黜，即它的功能被入侵的蛋白質利用開關的屬性關閉掉。

幹細胞是還沒有『貼上』『封條』的『新鮮』細胞，相當於剛剛受精的胚胎細胞，除了沒有『封條』，它同時齊備了所有準確分裂所必需的酶，因此可以造就出一個完整而準確的器官。幹細胞和正常細胞的DNA不會不同，所不同的肯定是控制DNA的酶。
為甚麼生物會衰老、死亡？因為控制DNA的酶會變異引致生命畸形，最後死亡。蛋白質的分子開關屬性必然進化到有性繁殖，形成有性繁殖是生物會死亡的一種自然更正機制。DNA可以由酶來偵錯，是因為DNA的線性結構，蛋白質是三維結構，偵錯似乎是不可能的，尤其讓酶自己來偵錯幾近異想天開，至少，自然界還沒有進化到這個層次。道家和佛家的修煉是不是有這個玄機，尚待研究。
蛋白質分子開關的複雜性，亦進化出形形色色的繁殖途徑。因此，精子和卵子的結合可以產生正確執行分裂指令，同時又可以正確『讀取』鄰近細胞的訊息來調節分裂程序的酶。
因此，當精子、卵子結合後如果不曾受阻，就會分裂而構造出一個完整的生命。當然，幹細胞也是具有執行正確分裂指令的酶。如果將幹細胞殖入子宮，將會發生甚麼事？已經有科學家找到了一個特殊的酶，可以將幹細胞催化成胚胎。因此我們如果想為所欲為的控制生命，我們一定得瞭解守護神是哪些酶。
※南韓首爾大學首席教授黃禹錫最近將九名年齡介乎兩歲至56歲的病患者的皮膚細胞，放入18名女性捐贈的185個卵子，成功複製出11個胚胎幹細胞。幹細胞是指能長成各種細胞和組織的原始細胞。此法可令患者用自己的幹細胞，更換細胞和組織，且不會出現排斥。之所以可以這麼做，因為卵子裏有一種酶可以改變DNA的原有守護神－－酶，在不變DNA的情況下而改變了細胞的功能。

黃禹錫的創舉，再一次證明了蛋白質才是生命的主宰。問題是：如果病者罹患的是先天性疾病，病人本身的細胞的DNA就有問題，用自己的細胞治療自己的先天性疾病，理應不通，否則，這將是對生命學的一個重大啟示。一般來說可以用自己的細胞治療自己身上後天損傷和退化的器官，這是毫無疑問的事。
既然科學家可以培育出胚胎幹細胞，我們有理由期待他們也可以用類似的方法將癌細胞改造成正常細胞。而佛家和道家關於單修性或性命雙修的傳說，不能完全斥責為荒誕不經。
生殖器官製造精子、卵子的的過程正是DNA的控制酶而不是DNA本身的純化過程。因此有性繁殖間接證明了是蛋白質控制DNA。
如果XY是雄性，XX是孕育下一代的雌性，YY不可能存在。如果將幹細胞裏的染色體換成YY，會有甚麼後果呢?
　

生命現象的大分類

體現在原核生物到人類身上的生命現象是宇宙間最複雜的現象，筆者嘗試將它分解成：本能和智慧。
到現在為止，蛋白質在DNA裏寫入了兩個程式：第一生命程式和第二生命程式。第一生命程式可以叫做本能程式，第二生命程式也可以叫做智慧程式。本能程式是任何今天仍然自然存活的生命所必須俱備的。沒有本能程式，生命就不能自然存活並繁衍下來。智慧程式是蛋白質最近六百萬年才組合出來，體現在人類的身上，仍然在進化過程中。

本能是一種預設的指令，是不能被自身取消、中止的生命指令，如因外界的原因而生命自身無法繼續執行，則將即時損害生命，或不能再繁衍下去。
有些生命指令是可以被自身取消、暫時中止，取消或暫時中止不會損害生命，卻可能是：失去了一次優化生命的機會，或制止了劣化生命。
而這個動作將會即時『寫入』生命程式裏作為下次採取動作的指南。這樣的指令或程式，可以稱之為智慧程式。因此，智慧程式的存在使學習這種現象成為可能。這就是『學習』的生命學原理。因為這樣的指令往往成了預設指令，因此這個特別『寫入』的程式的智慧級數將會降低而變成本能程式。因此，『人們的社會存在決定人們的思想意識』的生命學原理正是在長期生活中不斷寫入的智慧程式成為預設程式。
學習就是將外界的訊息寫入智慧程式，一個人最初寫入智慧程式的是在母體裏聽到的聲音。因此，胎教成為可能。這種寫入只是建立聲音的記憶體，打下未來辨識聲音的基礎，而不是建立概念。出生後除了繼續寫入聲音，也開始寫入看到的影像，也只是建立影像的記憶體，打下未來辨識影像的目的，也不是建立概念。這是單個記憶體的建立階段。概念必須是各個記憶體之間的關係的辨識，是記憶體的群體。這個是辨識群體記憶體的階段。
單個記憶體只是建立客體和中樞神經裏蛋白質之間的對應，概念才是對一個事物之不同於另一個的辨識。學問是概念之間的複雜邏輯關係。而基本邏輯是孩童就應該有的一種顯然因果關係的共識。這就是學習的生命學基本原理。如果我們對某種事物的學習發生困難，最大的原因是我們對學習的這三個程序原理產生誤解而關閉了自己的智慧程式，固執的抗拒寫入。例如，我們學習網頁語法，往往先執著於每一個字元的概念建立。正確的第一步應該是辨識這段語法達到的效果，哪些是可以完全照抄而不須理會含意的語法，哪些才是想取得效果而需要自己組織的內涵。步驟顛倒，你就永遠無法學習，而不是學會了。道理非常膚淺，上樓梯，明明第一步就是最低的那一級，可不知為甚麼卻認為最上面的才是第一級，當然拒絕跨上最低那一級了，結果永遠上不了樓梯。
本能和智慧程式的區別是：本能程式是生物在幾十億年中長期『寫入』並具有遺傳性，老虎的下代必定是老虎。是生命及物種得以保存並繁衍下來所必須俱備的程式。是所有生物必須具有的程式。智慧程式是生物離開母體後才『寫入』的程式，不具有遺傳性，物理學家的後代不會是物理學家。智慧程式可以改善本能程式，卻不能取代也不能改變本能程式。改善和改變的區別的研究將會成為生命學的一個專門課題。人類取得智慧程式完全是蛋白質的分子開關屬性的原因。而語言和文字的發展加速了智慧程式的進化，進化到最後必然使人類完全脫離禽獸的範疇，但今天人類還沒有真正脫離禽獸的行列。

不同頻率變化的聲音，由光線受物體干擾而變化構成的線條是客觀存在，並不取決於生物的耳朵或眼睛是否可以感受。生物是否可以辨識聲音或線條卻完全取決於它的中樞神經是否可以即時製造出可以對應的蛋白質。事實是生物長期接受大量重覆的聲音或線條刺激，促使中樞神經進化到可以固定製造對應的蛋白質。同時對應的蛋白質可以指令聲帶重發相同的聲音。同理，眼睛也使中樞神經得到了一樣的進化，並指令手指可以重覆繪出相同的線條。進一步的進化，將聲音數碼化成語言，語言統一了一個社群所見到、聽到、感到的訊息和想到的概念。
語言是無法儲存和遠距離傳遞的訊息資料。語言還有這樣的缺陷：語言是由音節構成一個數碼單元，相同音節編碼成的『話』，往往是複義的，即意義並非唯一，例如星星和惺惺及猩猩的含意是無法由語音辨識，但文字就一目了然。人類使用語音的歷史有上百萬年，對生命程式分化出智慧程式肯定起作用，漫長的進化曝露了語音的缺陷，因此文字的發明是必然的事。
結繩記事是一個過渡階段。
在人類使用語言之後的幾十萬年甚至百萬年之後，人手逐漸精巧化，可以繪出變化多端的線條，眼睛並可以辨識變化多端的線條，並將線條數碼化成文字。同時使得語言和文字互相對應，文字是可以永久儲存和遠距離傳遞的訊息資料，從此開始了人類的文化歷史。結果人類的智慧程式獲得了神速的進化，遠遠拋離了其它生物，使人類成了地球的主宰，從而蛋白質也成了宇宙的主宰。

語言和文字是使對應蛋白質精細化的根本原因。由於語言的傳播受時空限制，文字則沒有這個限制，因此語言對智慧的進化遠遠沒有文字的作用神速，人類懂得使用語言比會使用文字要早上數十萬年甚至上百萬年。神話就是人類在會使用文字之前一代一代用語言傳下的人類對大自然重大變故的記憶及其揣測。
人類各自發展出不同的語系，我們憑甚麼在兩個不同的語系之間進行翻譯？語系和智慧程式進化的關係又如何？會不會使用文字肯定決定了智慧的高低。電腦網絡的記憶容量和存取速度遠遠超過書籍，電腦的使用必然使人類的智慧獲得極速進化。
實際上，是語言和文字格式化了『腦記憶體』，語言和文字編碼的複雜程度決定了『腦記憶體』的精細度，而組合能力及抽象能力，決定了智慧的高低。智慧分出高低，並不意味著有專業知識的人必然是高智慧的人。
在中樞神經裏開放的智慧程式的完善程度決定了一個人的學習能力，決定了在發育階段寫入量和頻密度的承受能力，它決定了一個人所能建立的神經突兀的多寡，神經突兀之間的接通網絡則取決於一個人的綜合和抽象能力，這個網絡的四通八達可以通過勤奮的思索而獲得，能否勤奮則又取決於智慧程式的完善程度和本能程式。因此，一個人如果想提高自己的智慧，發育階段的勤奮是必不可少，否則就浪費了蛋白質提供的優良智慧程式。而在發育階段建立起來的大量神經突兀和四通八達的突兀網絡必定可以受惠一生。這是聰明的生命學原理。大量的神經突兀使一個人學識淵博，突兀網絡的四通八達使一個人的大智大慧。

　

蛋白質如何執行指令

同卵孿生嬰兒，他的本能程式是一樣的，因此具有相同的性狀特徵。由於智慧程式的架構一樣，性格也會近似。但由於各人的際遇不同，成長過程中寫入智慧程式的訊息一定不同，因此他們的性格就會有差別，他們就具有了不同的智慧和靈魂。『靈魂』是特別個人化了的『東西』。例如，醫學史曾經記錄到一個二十多卅歲的女心理學家，因為中風，利用最新的療法，不但醫好了半身不遂，還使自己成了藝術家，她對自己曾經是心理學家一事竟然一無所知，人們都說她換了另一個『靈魂』。
例如，當一個人的性器官還沒有發育的時候，對異性和同性的感觸完全一樣。當一個人的性器官發育趨於成熟時，會釋放出性荷爾蒙，荷爾蒙是一種蛋白質，隨著血液流到中樞神經，開啟了中樞神經的本能程式，因此，視覺、聽覺、嗅覺（普遍存在於昆蟲界）和感覺就開始緊張起來，辨識收到的光、音、化學和物理訊息，搜索適合繁殖的性對象。這時候，並不需要任何人的啟示，就會辨識出同性和異性的區別。（同性戀是異性戀的錯體，他的本能程式將兩性的位置倒置，攜帶了相反的指令。）看到異性的一舉一動，異性軀體的曲線，聽到異性的聲音，嗅到異性身上散發出來的氣味都會加速心臟跳動，引起他的性亢奮。而一個已經過了生育期的異性，並不可能挑動他的神經。這是不言而喻的『常識』。
科學家觀察到動物界的一種現象：雄獅、雄虎等一些生物稱王之後，會襲擊母獅等身邊幼獸，將它們殺死。這是甚麼生命機理呢？

當母獸正在養育幼獸時是不會發情，為甚麼雄獅懂得這個道理？為甚麼雄獅知道幼獸不是它所出？野獸劃分地盤都是以尿液為據，這是尿液揮發出的蛋白質中含有野獸個別的標籤蛋白質，雄獅正是以此判斷幼獸是否為己出。至於為了促使母獸發情云云，純屬人們智慧程式的錯誤組合和抽象。
和獅虎相反，大象等一類野獸反而會收留所有的幼獸。所以說，保護後代是保留物種的說法並不確切。
從阿里斯多德，甚至更早開始，到哥白尼，人們天天看到日出日落，太陽繞自己運行，也是不言而喻的『常識』。有沒有人想過，令人心動的一定是青春異性，看到三圍的曲線（上圍和下圍的大強烈顯示出特別優異的繁殖能力），就確確實實感覺十八無丑女，為甚麼？有沒有人想過，為甚麼不是自己繞著太陽轉？這些類似的問題明顯的牽涉的智慧層面。繞開智慧層面，前者的深刻道理在於蛋白質在作祟，沒有這些蛋白質，眼裏絕對出不了『西施』！這是『愛情』的生命學原理。蛋白質寫入的『愛情程式』，『目的』很簡單，只是為了保留物種，最終就是保留蛋白質自己。但人類的愛情故事卻是可歌可泣，哀怨繾綣，又是怎麼一回事呢？在動物界裏大概只有鴛鴦、犀鳥等少數鳥類是雌雄從一而終，甚至當配偶身亡後另一隻亦會憂鬱而死。這其中的生命學機理又是甚麼呢？也許本是平平無奇繁殖現象，卻被文學家渲染成神泣鬼哭、感天動地的愛情故事。說得天花亂墜只是文學家自己的事，能令他人感動卻又是甚麼生命學機理呢？
交媾後，如果成功懷孕，胚胎釋放出來的蛋白質就會『關閉』性器官的性荷爾蒙『釋放器』，這時雌性的性『趣』就完全消失。

有一種鳥類，雌性產卵後孵化和撫育下代的工作卻由雄性完成，因此，失去『性趣』的是雄性而不是雌性，這是蛋白質在漫長的進化中產生的一種錯體。
當生物的胎兒或蛋發育成熟後一樣會釋放出一種蛋白質，當子宮壁肌接收到時會即時引發痙攣而將胎兒或蛋排出體外。
以色列希伯萊大學心理學教授艾斯登（R.Ebstein）發現「冒險基因」與「利他基因」，證明一個人的性格來自本能程式。
兩個具有相反性格的人對同一件事的反應會完全不同。如果人的行為是根據本能程式對事件反應，產生的蛋白質會刺激神經傳導物質多巴胺接受體（dopamine receptor），令腦部產生良好感覺，蛋白質執行的指令至此才可告一段落。
當軀體接收到一個訊號，不管是來自軀體內部還是外部，啟動了本能程式而釋放出蛋白質攜帶的指令，驅動軀體作出行動，行動完成之後軀體會釋放出另一種攜帶指令蛋白質，這個蛋白質將會關閉驅使行動的蛋白質而終止軀體對這個訊號的反應。多巴胺接受體似乎就是攜帶終止指令的蛋白質。科學家觀察到天生有行為缺陷的兒童，例如暴力傾向，暴燥，可以通過大量食用深海魚類而使他們的行為獲得改善。
初步認為是Ω-3起作用。Ω-3或者就是攜帶終止指令的蛋白質。這種攜帶終止指令的蛋白質並不能由智慧程式產生，智慧程式只能是借助另一種訊號來產生並非完全對應的攜帶終止指令的蛋白質而緩解。而一個人必須確認智慧程式的存在，才可能利用智慧程式來改善自己的性格。
性格就是根據本能程式對外界某類訊號作出類似反應行為的總稱。因此一個人的性格決定了一個人感情模式。
一個人在十八歲，尤其是十四歲以前是根據本能程式行動，除了學識，這個年紀的人會選擇性的拒絕寫入，因此是不會有智慧，尤其是高級智慧。

因此，有性格就不會有智慧。性格可以是卑劣，也可以是優良。卑劣的性格會抑制智慧的發展，優良的性格可以促使智慧發展。
由於蛋白質如何執行本能程式，生物領域裏的科學家都已經進行了大量的研究，成果豐盛，因此，筆者把注意力放在智慧程式上。
　

智慧程式和智慧

本能程式是不可以在後天寫入的程式。智慧程式是允許在後天寫入的程式。寫入之後，也會淪為預設程式，一旦需要，蛋白質會將它尋出，根據它做出反應。因此，我們看到，人們會根據本子辦事，而不是根據已經變化了情況做出反應。這就是人們的社會存在決定人們的社會意識的生命學原理。
人們的社會意識，就是人們由小到大從生活環境，因而是社會大氣候得到的訊息一點一滴寫入智慧程式。這個訊息絕對不會僅僅是來自家庭環境和工作環境，同時家庭環境和工作環境亦受社會大氣候左右，因此，階級這樣的概念，完全是小農的一廂情願，子烏虛有的概念。在典型的小農經濟社會裏，人們的意識就是小農意識，而利益衝突只是本能的衝突，衝突雙方的地位並不具有特殊性，也不是一成不變。以生命學的原理來理解社會意識，社會衝突，比以階級和階級鬥爭了理解社會意識，就更具有普適性。社會生產力的發展完全是由普適的生物本能帶動。生物本能不僅帶動了社會生產力的發展，生命進化的原動力根本就是生物本能，社會進化的原動力除了本能，蛋白質最近進化出來的智慧也正在起決定性的作用。

在發育時期，即細胞關閉分裂功能之前，勤奮學習，頻密的寫入，將會為一個人的智慧進化打下牢固的基礎。如果錯過了發育時期的頻密寫入機會，這一生人的智慧發展就沒有了機會。這是因為智慧的第一要素是對事物的高度辨識率。如果對兩件事物都無法辨識，智慧就無從談起。辨識率絕對和學識成正比。一個人的學識廣泛，當中樞神經接收到一個訊息時，會將曾經寫入的有關資訊從『記憶體』盡可能搜索出來，顯然曾經寫入的資訊越廣泛，可以用於做出反應的根據選擇就越多，反應獲得的預期效果就越理想。
智慧程式有一項功能，當中樞神經收到一個訊息的時候，就會將與這個訊息同義和反義的記憶體『全部』激活，這個機制稱為反饋機制。『全部』到甚麼程度，端視突兀網絡的貫通程度。
這些記憶體的多寡也端視這之前寫入的多寡。這些記憶體會被預設的智慧程式篩選。如果閣下『不假思索』的接受預設的智慧程式篩選，閣下就是蛋白質的傀儡，相反閣下就是一個有智慧的人。
對同樣的訊息，一個不依靠預設智慧程式的人可以看到只靠預設程式的人所沒有看到的問題。因此預設智慧程式是提高智慧的最大障礙。偏見或成見是最典型的預設智慧程式。
如果腦裏已經建立了0和1的記憶體，00、001、0101等等是組合的結果，組合量的涵蓋面叫慎密度，組合的反向是分析。將0想像為『人』，00設定成『特定歷史時期的人』是抽象能力。抽象能力表現在當見到一件事物的時候是否能夠將它與另一件事物掛上鉤。
例如，光速在不同的測定下都是同一個值，和物理學家羅侖斯的一個關於速度的公式，在上個世紀開始前後都已經眾所周知的事實，但只有愛因斯坦看出將這兩件事聯系起來的時候會揭示出一個牛頓力學所完全陌生的物理世界。

這個現象的生命學原理說穿了一點都不希奇：除了愛因斯坦和他的太太之外的所有物理學家從小就不斷將牛頓力學和日常生活中的訊息寫入自己的智慧程式，形成了揮之不去的預設程式，絕對參考系統存在的情況下怎麼有不變的速度呢。愛因斯坦及太太因為拋棄了蛋白質預設的智慧程式，不受公認的常識影響，所以才會有驚世駭俗的見解。
要提高觀察問題慎密度和分析問題的能力，解數學題是最好的訓練方法。影響智慧的第二、第三要素是組合能力和抽象能力，這兩個能力的效益依賴學識淵博，而當智慧程式被蛋白質設成預設程式的時候，組合和抽象能力就即時被關閉。
最終決定一個人的智慧是他對生命學的瞭解。
既使是智慧程式，都會成為預設程式，不論是否成功過，讓它永遠可以重新寫入，這才是智慧程式的涵義。能夠改變自己是一種智慧，因為他可以將智慧的預設程式拋棄。因此，智慧可以分成兩級──低級：可以寫入，卻將寫入後的程式變成預設程式，限制第二次重寫；高級：可以寫入，並不在寫入後變為預設程式，隨時準備重寫。人類目前的智慧水平絕大部份仍然處於低級，因此，我們看到了亂糟糟的社會現象，所慶幸的是，經濟活動這個火車頭還能拖動人類向更高級的智慧進化。高級智慧亦可以理解成社會智慧。
智慧的高低並不取決於學識的多寡。一部被命名為『藍鳥』的IBM超級電腦，其專業『知識』無可比擬，但因為是先天『寫入』，並成為預設程式，所以並不具有智慧。
從來不根據預設程式去思考和行動的人，才配稱為有智慧的人。倨傲是一種本能，它不讓自己有機會重新寫入。一個傲慢的專業人士只是一個沒有智慧的人，他的智慧程式並沒有幫他克服醜陋的本能。

他的專業學識充其量也只是和『藍鳥』同級而已，也像『藍鳥』一樣，充其量也只是一部超級電腦而已。謙虛是一種智慧，它讓自己有機會重新寫入。
因此，智慧是指一個人已經不是蛋白質的傀儡，清晰的知道自己在做甚麼，也能夠認真瞭解他人對自己行為的反應，既不讓蛋白質限制自己，能夠給自己一個改變的機會。智慧不是指他的專業知識。一個人的行為已經不具有生物本能的模式，而又有淵博的學識，才能稱之為智慧。
今天人類所面對的各種社會問題，正是智慧程式為本能作倀的結果，而這根本不是蛋白質進化的必然結果。智慧的高低就是對自己瞭解的程度，對世界、社會和自己的關係的瞭解程度。沒有淵博的學識就一定不能認識生物本能是甚麼，有淵博學識卻又未必能認識生物本能是甚麼，只有智慧，才可洞察一切。這就是學識和智慧的區別。
學生時代，尤其是高中到大學的時代是一個人最頻密寫入的時期，學識的急速增長，給這些學生一種錯覺，認為學識即是智慧，為攀上學識的高峰而沾沾自喜，卻不知過了學識的高山才是智慧的深海。筆者祝福這些人一生好運，否則一次挫折就足於把他們打回原形，尤其是在現代市場經濟分工極細的情況下。
除了學生時代，輕易取得成功的人，或幾經辛苦才取得天下的人，也往往和學生一樣，誤把成功當成智慧。
說到這裏，已經闡明了生命學的最基本原理或假設。接下去，用這個原理論證一些關鍵的實驗事實，通過這些論證，反過來確認這個生命學的最基本原理。

　

生命學的課題

人類在研究生命課題的時候，是到了需要正確估量蛋白質和DNA在整個生命活動中的作用的時候了。只有這樣，人類才能夠抓到生命的本質，在解決人類健康問題的時候，在提高自身智慧的時候不至於走冤枉路。
生命學最重要的一個結論或原理就是每個人在智慧程式成為預設程式的時候都只是蛋白質的傀儡。明乎此，在任何情況下，就可以保持清醒和冷靜的思維和行動，就會非常清晰的知道自己正在做甚麼，在這個時候，也只是在這個時候，人才具有了至高無上的智慧。如果社會裏的每個人都明乎此，人類就找到了自己的最終歸宿。
在今後的研究中，筆者將主要闡述人類社會各種現象的生命學原理，對社會行為進行剖析，辨識它到底是基於本能程式或預設程式，還是基於沒有成為預設程式的智慧程式，希望可以藉此梳理出一條人類，或人類社會進化的清晰路徑。
一個人，甚至一個領袖，在他的行為中，到底有多少是真正根據智慧程式行事，而不是根據本能程式或預設的智慧程式行事，就決定了他的智慧的高低。問題是，我們如何判定一個行為是本能，或者是一種智慧？一個領袖常常被愚民神化成智慧的化身，如果以今天的生命學觀點分析，他們可能通通都是一群本能的生物而已。
生命學就是想尋找一個使人類可以擺脫醜陋的本能，真正利用蛋白質進化形成的智慧程式提高自己的智慧水平，完成生命的最終進化。

人類只有在為自己找到圓滿的最後歸宿，建立了一個真正平等而和諧的社會時，才能宣佈這個智慧的進化可以結束。人類也只有找到蛋白質的組合方程式(這應該是蛋白質組學──Proteomics的課題)後才可以宣稱已經掌握了生命。生命的神奇就在於生命可以宣佈自己找到了自己的秘密。

　
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